Upravni odbor Vijeća uspostavio je slijedeće regionalne odbore – podružnice:
Regionalni odbor VKBI Srednje podrinje (Zvornik)
RO VKBI Srednje podrinje obuhvata teritorije općina Vlasenica, Milići, Šekovići, Bratunac, Srebrenica i Zvornik. Sjedište Regionalnog odbora je u Zvorniku.
Predsjednik Regionalnog odbora VKBI Srednje podrinje je Esad Hasanović.
Regionalni odbor VKBI Hercegovine (Mostar).
RO Hercegovine obuhvata: Iz FBIH obuhvata teritorije općina:Grad Mostar, Konjic, Jablanica, Prozor-Rama, Posušje, Grude, Široki brijeg, Ljubuški, Čitluk, Čapljina, Neum, Stolac, Ravno, Kupres FBIH, Tomislavgrad, Livno, Glamoč i Bosansko Grahovo; Iz RS obuhvata teritorije općina: Mostar-Istočni Mostar, Nevesinje, Gacko, Stolac/Berkovići, Ljubinje, Bileća, Trebinje, Kupres RS.
Sjedište RO Hercegovine je u Mostaru.
Predsjednica Regionalnog odbora VKBI Hercegovine je emeritus prof.dr. Elbisa Ustamujić, podpredsjednik je prof.dr. Emir Fazlibegović, a izvršni sekretar podružnice je mr.sci Alden Kajtaz.
e-mail: elbisa.ustamujic@unmo.ba
Regionalni odbor VKBI Bosanske Krajine (Bihać).
RO Bosanske Krajine obuhvata: Iz FBIH obuhvata teritorije općina: Velika Kladuša, Cazin, Bihać, Bos.Krupa, Bužim, Bos. Pterovac, Sanski Most, Drvar, Ključ. Iz RS obuhvata teritorije općina: Kostajnica, Bos.Krupa-Krupa na Uni, Bos.Novi-Novi Grad, Bos.Petrovac-Petrovac, Sanski Most-Oštra Luka, Drvar-istočni Drvar, Ribnik.
Sjedište RO Bosanske Krajine je u Bihaću.
Predsjednica Regionalnog odbora RO Bosanske Krajine je prof.dr. Vildana Pečenković.
Regionalni odbor Tuzla (Tuzla)
Iz entiteta FBIH obuhvata dio općina Tuzlanskog i Posavskog kantona i to teritorije općina: Odžak, Domaljevac-Šamac, Orašje, Gradačac, Doboj istok, Gračanica, Lukavac, Srebrenik, Tuzla, Čelić, Teočak, Banovići, Živinice, Kalesija, Sapna, Kladanj. Iz entiteta RS obuhvata teritorije općina: Derventa, Bosanski brod, Odžak-Vukosavlje, Bosanski Šamac, Orašje-Donji Žabar, Modriča, Gradačac-Pelagićevo, Bijeljina, Lopare, Ugljevik, Kalesija-Osmaci.
Sjedište RO Tuzla je u Tuzli.
Upravni odbor 10. februara 2022. imenovao je Regionalni odbor VKBI Tuzla , na čijem čelu se nalazi predsjednik prof.dr. Elmir Jahić dok je podpredsjednik prof.dr. Amir Karić.
Regionalni odbor Banja Luka (Banja Luka)
RO Banja Luka iz RS obuhvata teritorije općina Bosanska Dubica, Prijedor, Bosanska Gradiška, Laktaši, Srbac, Prnjavor, Banja Luka, Čelinac, Mrkonjić Grad, Skender Vakuf-Kneževo, Kotor Varoš.
Upravni odbor je 4.11.2009. godine uspostavio Inicijativni odbor za uspostavu RO Banja Luke, na čijem se čelu nalazi koordinatorica Anita Hodžić iz Prijedora.